Кишечная палочка (Escherichia coli) является самым первым санитарно-показательным микроорганизмом, используют эту бактерию в качестве показателя фекального загрязнения воды.

E.coli имеют высокомолекулярный термолабильный токсин, который действует аналогично холерному, вызывая холероподобную диарею (гастроэнтериты у детей младшего возраста, диарею путешественников и др.)

Цисты паразитов, таких как Entamoeba histolytica или Balantidium coli часто сопротивляются хлорированию и поэтому могут вызывать переносимые водой вспышки дизентерийных заболеваний. Цисты эксцистируют в тонкой кишке, образуя трофозоиты. В некоторых случаях трофозоиты могут попадать в портальную вену и вызывать печеночный амебиаз и последующий амебный абсцесс печени. 

Общее микробное число (ОМЧ) – это количественный показатель, отражающий общее содержание мезофильных аэробных и факультативно анаэробных микроорганизмов в 1 мл исследуемой воды. Данный тест имеет невысокую ценность как индикатор присутствия патогенных микроорганизмов, тем не менее, ОМЧ-37°С является важным санитарным показателем, который позволяет оценить общую микробную обсемененность водного объекта.

Общее микробное число (ОМЧ) это один из основных показателей, определяемых в ходе санитарно-микробиологических исследований. Его значение выражают в колониеобразующих единицах: КОЕ/мл или КОЕ/см3. Считается, что чем выше ОМЧ, тем вероятнее присутствие в исследуемом объекте патогенов. ОМЧ однозначно соотносится лишь со степенью загрязненности объекта органическими веществами. Однако это важный санитарный показатель, поскольку он позволяет оценить чистоту и качество дезинфекции воды.

Колифаги  - это микробные индикаторы, которые могут использоваться для мониторинга потенциального загрязнения питьевой воды фекалиями.  Колифаги представляют собой вирусные структуры и, по сравнению с бактериальными показателями, более устойчивы к дезинфекции и распространяются на большие расстояния от источников загрязнения. Таким образом, присутствие колифага может служить лучшим показателем качества грунтовых вод.

Представляет собой вездесущий микроорганизм, обладающий способностью выживать в различных условиях окружающей среды. Он вызывает заболевания не только у растений и животных, но и у людей, вызывая серьезные инфекции у пациентов с ослабленным иммунитетом, больных раком и пациентов, страдающих тяжелыми ожогами и муковисцидозом (МВ). Большинство штаммов P. aeruginosa продуцируют один или несколько пигментов, в том числе пиоцианин (сине-зеленый), пиовердин (желто-зеленый и флуоресцентный) и пиорубин (красно-коричневый).

Сульфитредуцирующие клостридии способны существовать в воде значительно дольше, чем колиформные организмы, и они более устойчивы к обеззараживанию. Их присутствие в прошедшей дезинфекцию воде может указывать на ее недостаточную очистку и, следовательно, на то, что устойчивые к обеззараживанию патогенные микроорганизмы могли не погибнуть.

Наличие фекальных стрептококков/ энтерококков свидетельствует о фекальном загрязнении. Фекальные стрептококки, как правило, дольше сохраняются в окружающей среде, чем термотолерантные или тотальные колиформы, и обладают высокой устойчивостью к высыханию. Таким образом, можно выделить фекальные стрептококки из воды, которая содержит небольшое количество или не содержит термоустойчивых кишечных палочек, например, когда источник загрязнения удален во времени или пространстве от точки отбора проб.

Легионелла обитает в водопроводных трубах и может жить в емкостях с водой в помещении, где температура составляет от 20ºC до 50ºC.

Legionella pneumophila поражает легкие и вызывает иногда смертельную форму пневмонии. Legionella pneumophila, например, является теплолюбивым организмом, который имеет более высокую устойчивость к хлору, чем большинство бактерий, и может жить внутри клеток паразитов, защищаясь от этих способов очистки.

Личинки гельминтов могут плавать в воде или же прикрепляться к водорослям – в этом случае заражение происходит во время питья зараженной личинками сырой воды, обработки этой водой овощей, фруктов и посуды, употребления в пищу инфицированных водяных растений.Яйца и личинки гельминтов, паразитирующих в печени, желчевыводящих путях, поджелудочной железе и двенадцатиперстной кишке, обнаруживают в желчи и дуоденальном содержимом.

Основной путь передачи цист лямблий – водный. Цисты лямблий остаются жизнеспособными в воде при температуре 4-20 С до 3 месяцев. Особое значение для распространения заболевания имеет высокая устойчивость цист лямблий к дезинфицирующим средствам, в том числе хлорсодержащим. Обычное хлорирование водопроводной воды, обеззараживание воды бассейна не действует на них губительно.