Колиформные бактерии – это собирательное название некоторых энтеробактерий, обладающих общими чертами. К ним обычно относят кишечную палочку (E. coli), клебсиелл (Klebsiella), энтеробактер (Enterobacter), цитробактер (Citrobacter) и гафний (Hafnia). Присутствие в почве E.coli и Enterococcus faecalis указывает на свежее фекальное загрязнение; бактерии родов Citrobacter, Enterobacter и Clostridium perfringens - на давнее фекальное загрязнение. Высокая численность сапрофитной микрофлоры свидетельствует об органическом загрязнении.

Salmonella — палочковидные неспороносные бактерии, являющиеся абсолютными патогенами для человека. Эти микроорганизмы вызывают такие тяжелые заболевания, как сальмонеллез, брюшной тиф и паратифы. Патогенные бактерии человека, такие как Salmonella enterica, способны колонизировать культурные растения.Сохранение сальмонеллы в почве было более длительным в суглинистой, по сравнению с песчаной почвой, и при внесении вместе с органическим удобрением.

Обнаружение энтерококков в почве всегда свидетельствует о свежем фекальном загрязнении, каковы бы ни были другие показатели.Энтерококки — фекальные стрептококки, бактерии семейства Streptococcaceae, род Streptococcus. Энтерококки являются обитателями кишечника человека и теплокровных животных, они рассматриваются как санитарно-показательные и условно-патогенные микроорганизмы.

Самые распространённые на планете гельминты — это те, которые передаются через почву. Их яйца или личинки попадают в почву, покинув организм хозяина вместе с фекалиями. После чего (в большинстве случаев) им требуется время для созревания — от нескольких часов до нескольких недель (это зависит от вида и условий окружающей среды.