Колиформные бактерии, или БГКП – это собирательное название некоторых энтеробактерий, обладающих общими чертами. К БГКП обычно относят кишечную палочку (E. coli), клебсиелл (Klebsiella), энтеробактер (Enterobacter), цитробактер (Citrobacter) и гафний (Hafnia). Присутствие в почве E.coli и Enterococcus faecalis указывает на свежее фекальное загрязнение; бактерии родов Citrobacter, Enterobacter и Clostridium perfringens - на давнее фекальное загрязнение. Высокая численность сапрофитной микрофлоры свидетельствует об органическом загрязнении.

Энтерококки — шаровидные или овальные бактерии диаметром 0,5—1 мкм соединяются в пары или короткие цепи (в жидких питательных средах). Индекс рассчитывают по специальным таблицам. Так как S. faecalis отмирают в окружающей среде быстрее, чем S. faecium, обнаружение первого вида энтерококков свидетельствует о свежем фекальном загрязнении человеком исследуемого объекта.

К бактериальным возбудителям относятся представители родов Salmonella, Shigella, патогенные штаммы Escherichia coli, Campylobacter и пр. Практически все возбудители кишечных инфекций чрезвычайно живучи. Они способы подолгу существовать в воде, почве и на различных предметах (ложках, тарелках, дверных ручках и мебели).

ОМЧ - это общее число микроорганизмов на 1грамм почвы. Чистая почва содержит не более 1-1,5 млн. бактерий на 1 грамм. Во многих случаях почва селитебных территорий и агроценозов – это своеобразное депо и аккумулятор, обеспечивающий длительное сохранение возбудителей опаснейших болезней человека, домашних животных и культивируемых растений.

Степень фекального загрязнения почвы можно определить по количеству термофильных бактерий, температурный оптимум развития которых равен 58-60°С. Термофилы представлены в основном спорообразующими. грамположительными бациллами и актиномицетами, активно размножаются в компостных кучах, навозе. Поэтому можно заключить, что почвы, в которых обнаруживается большое количество эшерихий и термофилов, были удобрены навозом. Почва, содержащая много эшерихий и незначительное количество термофилов, считается загрязненной фекалиями.

Клостридии перфрингенс (лат. Clostridium perfringens) — вид бактерий, возбудителей газовой гангрены и токсикоинфекций человека. Clostridium perfringens часто встречается в почве (около 105 бактерий на 1 г почвы), уличной пыли, в сточных водах, различных отложениях почвы, а также в пищеварительном тракте человека и различных домашних и диких животных.